Шато Канон, расположенный на вершине известнякового плато Сент-Эмильон, имеет богатую историю, начав своё существование как часть виноградника Кло Сен-Мартен ещё в 1700-х годах. В 1760 году виноградник приобрёл Жак Канон, бывший капер, который расширил его до современных размеров и возвел замок, завершенный к 1767 году. После десяти лет владения он продал поместье торговцу вином из Бордо, Раймонду Фонтемуану.
Существует две версии происхождения названия Шато Канон. По одной из них, оно является фонетическим отражением фамилии первого владельца - Канона. Однако при приобретении поместья в Сент-Эмильоне семья Фонтемуан уже владела собственностью во Фронсаке под тем же именем, поэтому предполагается, что оба винодельческих хозяйства были объединены под одним названием. К 1770 году вина Шато Канон стали известными в Сент-Эмильоне, а название было официально закреплено в 1853 году потомками Раймонда Фонтемуана.
Семья Фонтемуа удерживала виноградники до 1857 года, после чего поместье сменило несколько владельцев и оказалось продано в 1919 году Габриэлем Супау в подарок своей дочери и зятю, Андре Фурнье. Семья Фурнье активно модернизировала производство, обновила замок и виноградники. Владение ими продолжалось до 1996 года, когда Шато Канон было приобретено братьями Вертхаймер, владельцами дома моды Chanel. После приобретения были проведены работы по обновлению оборудования, реконструкции шато и пересадке виноградников.
Под виноградниками находится уникальный комплекс тоннелей, использовавшийся для добычи известняка для строительства зданий Сент-Эмильона и Либурна, который сегодня привлекает туристов.
Общая площадь виноградников Шато Канон составляет 34 гектара, из них 24 отнесены к категории Premier Cru и используются для создания первоклассных вин.